|
|
Intracellular dinucleoside polyphosphates and methods of their detection
Říha, Jan ; Macíčková Cahová, Hana (vedoucí práce) ; Šanderová, Hana (oponent)
(CZ) Dinukleosid polyfosfáty jsou látky objeveny před více jak 50 lety, ale jejich role v buňce zatím není zcela pochopena. Některé teorie předpokládají, že hrají roli takzvaných alarmonů při vystavení stresovým faktorům, jiné teorie předpokládají jejich zapojení v buněčné proliferaci či v odpovědi na poškození DNA. Jedna z nových teorií předpokládá, že dinukleosid polyfosfáty fungují jako 5' RNA čepičky. K zjištění role těchto látek v organismu je potřeba znát jejich koncentraci v normálních i stresových podmínkách. V této práci se pokusím stanovit basální hladinu dinukleosid polyfosfátů v buňce a jejich změny v důsledky stresových podmínek, a to vše z již publikovaných dat. Důležitou součástí měření koncentrace jakýchkoliv látek je způsob, jakým jsou měřeny. Proto také podám základní přehled metod jejich měření, od starších metod postavených na reakcích luciferázy, k moderním a přesným metodám založených na hmotnostní spektrometrii. Klíčová slova: dinukleosid polyfosfáty, Ap4A, RNA čepičky, buněčný stress, LC-MS detekce a kvantifikace
|
|
|
Ap4A-RNA in IgE activated mast cells
Potužník, Jiří František ; Macíčková Cahová, Hana (vedoucí práce) ; Černý, Jan (oponent)
(CZ): Žírné buňky jsou buňkami imunitního systému přítomné ve tkáních. Mají širokou škálu funkcí a receptorů, včetně receptoru FcεRI, který se aktivuje vazbou na IgE navázaný na antigen. Když jsou buňky aktivovány tímto způsobem, jeden z procesů, který nastává je tzv. signální dráha LysRS-Ap4A-MITF, která vede k translokaci Lys tRNA syntetázy do buněčného jádra a aktivaci její nekanonické aktivity - tvorbě diadenosin tetrafosfátu (Ap4A). Ap4A je dinukleosid polyfosfát, typ molekul přítomných ve všech doménách života. Dinukleosid polyfosfáty se skládají ze dvou nukleosidů spojených dohromady 5 '- 5' fosfodiesterovým můstkem o různých délkách. Nedávno bylo prokázáno, že tyto molekuly slouží jako nekanonické iniciační nukleotidy transkripce u bakterií, kde fungují jako 5 'RNA čepičky, podobně jako dobře známá 7-methylguanosinová čepička eukaryotické mRNA. V této práci předkládám důkaz o existenci Ap 4A čepičkované RNA v žírných buňkách, 5' RNA struktuře, jejíž existence zatím nebyla popsána v eukaryotických buňkách, a pokouším se určit její roli při aktivaci těchto buněk a v širším kontextu imunitní odpovědi zprostředkované žírnými buňkami. Klíčová slova: žírné buňky, RNA čepičky, dinukleosid polyfosfáty, Ap4A, IgE, FcεRI receptor, Lys tRNA syntetáza
|
host ::
RSS.